This is in Russian, but seems to be using Anzick-1, Ust-Ishim, K14 to get the mutation rate. Fu et al. who just used Ust Ishim got 0.7-0.9 for this which seems very similar, and also identical to the 0.82x10-9 value of Poznik et al. So, for the time being this seems like the value to use, although tighter confidence intervals would be welcome.
The Russian Journal of Genetic Genealogy (Русская версия), Vol 6, No 2 (2014)/Vol 7, No 1 (2015)
Константа скорости SNP мутаций Y-хромосомы по данным полного секвенирования
Дмитрий Адамов, Владимир Гурьянов, Сергей Каржавин, Владимир Таганкин, Вадим Урасин
Abstract
Накопление данных тестирования BigY, FGC, с одной стороны, публикация сиквенсов Y-хромосомы древних образцов Anzick-1, Ust-Ishim, K14, с другой, дает возможность оценить среднюю скорость однонуклеотидных (SNP) мутаций. Авторы разработали собственный метод отбора истинных мутаций в современных и древних образцах и несколькими способами определили с высокой точностью константу скорости SNP мутаций - 0.82·10-9 в год на п.н.о. (95% CI: (0.70-0.94) ·10-9).
Link
No comments:
Post a Comment